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复旦团队开发术中三维病理平台,无标记成像30分钟出结荚|肿瘤|拉曼|胶质瘤|细胞瘤_网易订阅

发表于 2026-08-08 21:25:22 来源:知来藏往网
复旦团队开发术中三维病理平台,无标记成像30分钟出结荚|肿瘤|拉曼|胶质瘤|细胞瘤_网易订阅
本文是复旦分钟专业学术比如文解读,不做医疗提议。团队台无一块从手术台上取下的术中脑组织可能有几毫米厚,病理医生在术中真正能够看到的维病,却频仍只有一两张厚约 5 微米的理平瘤拉瘤网切片。胶质瘤尤其是标记胶质母细胞瘤,常见没有清楚条件的成像出结边界。肿瘤细胞会弥散地浸润周围脑组织,荚肿同时在不一样位置和深度分布不均。曼胶因此,质瘤如果切片没有覆盖到肿瘤细胞聚集的细胞区域,检查结荚就可能无法完善反映整块组织的易订阅真实状况。为认识决这个状况,复旦分钟复旦大学施立雪团队与季敏标团队合作,团队台无开发了一项名为 ULTRA 的术中高效高效三维病理技术,相关探究发表于 Cell。这项技术不需先把组织切成大量薄片,也不需开展传统染色。探究人员先让脑组织在几分钟内变得透明,再用受激拉曼散射显微镜逐层扫描,最后通过人工智能处理图像,生成病理医生熟悉的三维虚拟染色结荚。对于约 1 立方毫米的胶质瘤边缘样本,整套处理、成像和探究步骤可在约 30 分钟内实现。“我们最初想处理的,题是术中病理场景下的材料缺失状况。”施立雪告诉 DeepTech,“我们希望在术中尽可能呈现整个组织块的三维材料,减小二维切片采样不足带来的误差。”施立雪现为复旦大学生物医学探究院准聘副教授,题从事下一代生物成像技术及其生物医学采取探究,涵盖非线性拉曼成像、红外光条件成像,以及代谢成像、新型病理检测方式、界面水成像等。图 | 施立雪(来源:DeepTech)让三维病理赶上手术高效度施立雪对三维病理切片的关注,可以追溯到其博后时期。当时,她和团队开发了一种多色拉曼成像技术,通过将拉曼染料与组织透明化结合,可以在毫米级厚度的组织中开展多色免疫标记成像。通过标记不一样的蛋白,探究人员可以观察不一样类型细胞在组织原位的空间分布。这项工作让她产生了对三维病理的初步设想。然而,当时的探究思路更接近分子病理:先用染料标记特定分子,再观察它们在组织中的三维位置。回国后,随着她对人工智能、虚拟染色和图像处理的认识加深,加上季敏标团队之前在受激拉曼组织学算法部分的积往往,探究方向最初发生变化。团队逐渐从依赖分子标记的三维成像,转向无标记的三维形态病理。这一转向既来自技术积往往,也来自术中病理的现实需:关键让三维病理真正进入手术室,先必须把处理时间缩短到手术能够等待的范围。传统病理的金原则是石蜡切片。组织需经过固定、包埋、切片、脱蜡和染色等多个步骤,图像质量较高,但常见无法在手术流程中实现。术中常见采取高效度更快的冰冻切片,但冰冻可能造成组织变形,染色成效也不如石蜡切片。受时间限制,医生常见只能检查一两张切片,那么点儿遗漏组织中分布不均的肿瘤细胞。三维病理可以减小这种采样不足,但以往的方式同样很难进入手术室。它们常见需先让组织透明,再等待荧光染料进入组织,仅样品处理就可能花费两天左右。为了减小二维切片采样不足带来的误差,团队希望在术中尽可能呈现整个组织块的三维材料。但关键让三维病理真正进入手术室,先需把处理时间缩短到医生可以等待的范围。团队因此选项了无标记成像路线,用受激拉曼散射显微镜直接读取组织自身的化学材料。不一样化学键具有不一样的振动特点,这项技术可以识别组织中的脂质、蛋白质等成分。由于细胞核、细胞质和细胞膜的组成存在区别,探究人员能够根据这些信号分辨细胞和组织结构。“很难便捷地说哪一种方式更好。”施立雪表示,H&E 染色仍然是病理诊断的金原则。ULTRA 并不是关键说明无标记成像优于传统病理,而是希望在对时效性需极高的术中需下,给予尽可能接近传统病理的图像质量和更多的组织材料。图 | ULTRA 高效高效三维组织学方式原理示意图(来源:上述比如文)绕过染色后,团队还需处理另一个瓶颈:如何让光进入较厚的脑组织。脑组织含有大量脂质,光线进入后那么点儿发生散射,深层结构也因此难以看清。为开展三维成像,探究人员需先让组织变得透明,同时尽量保留其中可供拉曼成像识别的化学材料。施立雪验明正身,团队从已有探究中获得启发,通过变化细胞膜状态,加快透明化试剂在组织中的渗透。经过筛选,他们最后形成了一套由尿素、氘代 DMSO(二甲基亚砜)和环糊精组成的透明化方式划,并通过加热缩短处理时间。其中,环糊精可以去除部分胆固醇,提高组织通透性;采取氘代 DMSO,则可以减小往往见不鲜 DMSO 产生的拉曼信号干扰。采取这套方式,300 至 700 微米厚的脑组织可以在约 2 至 5 分钟内实现透明化,1 毫米厚的组织常见需约 5 至 10 分钟。组织透明后,受激拉曼显微镜会逐层采集图像,形成三维数据。人工智能随后对原始图像开展降噪、材料预测和虚拟染色,将其转换成接近传统 H&E 染色的图像,供病理医生观察。“无标记成像节省了染色时间,高效高效透明化缩短了样品处理时间,而人工智能处理了图像可读性状况。”施立雪总结方式。同时,ULTRA 基础上是一种无损的技术路线。实现成像后,同一份样本仍可后续用于常规病理、免疫组化和 RNA 探究,为它与现有病理步骤结合留下了空间。为胶质瘤病理提高一个观察维度为了将显微镜采集的原始拉曼信号,转化为病理医生熟悉且能够直接观察的切片图像,ULTRA 采取三个后续的人工智能模型处理数据。首先个模型负责去除深层图像中的噪声;第二个模型根据实际采集的脂质信号预测蛋白质材料,从而减小一个成像通方式,缩短扫描时间;第三个模型开展虚拟染色,把拉曼图像转换成接近传统 H&E 染色的图像。病理医生由此可以按照熟悉的方式,观察细胞核大小、细胞密度、组织结构和血管变化等特点,同时在不一样深度之间移动,查看完善的三维组织。然而,当 AI 参与图像生成,一个无法回避的状况是:它会不会“补出”原本不存在的细胞或结构?施立雪表示,团队在算法训练和验明正身中题关注了这一风险。其中,图像修复模型题学习噪声随成像深度发生的变化,而不是学习某种肿瘤应该首先什么样,以减小生成虚假病理结构的可能。季敏标团队之前积往往的大量脑组织虚拟染色数据,也为模型训练和验明正身给予了基础。为了验明正身这套方式能否用于真实的脑肿瘤样本,探究人员先在人脑和小鼠脑组织中测试了成像成效,并将虚拟染色结荚与传统病理开展比较。在目前的测试范围内,ULTRA 得到的细胞密度等材料与传统 H&E 病理较为相同。在此基础上,团队进一步探究了 17 名脑肿瘤患者的手术样本。患者年龄在 35 岁至 75 岁之间,涵盖 4 例星形细胞瘤、5 例少突胶质细胞瘤、5 例胶质母细胞瘤,以及 1 例儿童弥漫性半球胶质瘤和 2 例低级别胶质瘤。在这些样本中,ULTRA 呈现出了不一样类型胶质瘤的典型病理特点。例如,少突胶质细胞瘤中较为均匀的圆形细胞核,星形细胞瘤中的细胞核异型,以及胶质母细胞瘤中的微血管增生和坏死。由于获得的是完善的三维数据,探究人员还可以进一步探究细胞核的体积、密度及其在组织中的空间分布。相比呈现不一样胶质瘤的典型形态,ULTRA 更题的采取,是观察肿瘤如何向周围脑组织浸润。图 | ULTRA 提高胶质瘤浸润边界的勾勒成效(来源:上述比如文)胶质瘤具有弥散生首先的特点,但真正不易的是观察到肿瘤细胞究竟扩散到了哪里,以及如何更准确地判断肿瘤与周围脑组织之间的过渡区域。在一块约 1 立方毫米的胶质母细胞瘤边缘样本中,ULTRA 呈现了从致密肿瘤区、稀疏浸润区到相对正常脑组织的过渡。结荚显示,胶质瘤边界并不是一个平整、清楚的切面,而是一个随组织深度不断起伏和变化的立体区域。这种空间区别也验明正身了二维切片可能存在的局限。当两名病理医生分别查看三维数据中的单层图像时,都漏掉了部分只在其他深度显现的肿瘤区域,漏检比例分别为 20% 和 23%。这并不意味着医生没有识别出眼前的病理特点,而是所观察的平面可能恰好没有覆盖到肿瘤。探究人员还探究了临床上较难判断的区域。在两份取自 MRI 水肿带的样本中,ULTRA 观察到了明显的肿瘤浸润;同时两份在术中导航上看似正常、神经电生理监测也呈阴性的样本,同样显示出肿瘤往往及。这些结荚进一步表明,肿瘤细胞在组织中的分布可能具有明显的深度区别,而三维病理能够给予二维切片难以呈现的空间材料。未来,施立雪希望 ULTRA 能作为一种补充工具,在冰冻切片结荚不够清楚,或者医生希望认识肿瘤在不一样深度的分布时,给予额外的空间材料。目前,ULTRA 题呈现细胞和组织的形态。未来,团队希望进一步利用图像算法推断蛋白质表达或转录组特点,将其从无标记三维形态病理拓展到无标记三维分子病理。“详详见细来说,我们希望在三维组织中,不仅观察细胞和组织的形态,还能够通过算法推断某些分子标志物的表达状况,从而在无标记需下获得三维分子病理材料。”1.Liu et al., Ultrarapid deep 3D histology enables intraoperative mapping of glioma infiltration, Cell (2026), https://doi.org/10.1016/j.cell.2026.07.0262.Shi, L., Wei, M., Miao, Y. et al. Highly-multiplexed volumetric mapping with Raman dye imaging and tissue clearing. Nat Biotechnol 40, 364–373 (2022). https://doi.org/10.1038/s41587-021-01041-z运营/排版:何晨龙注:封面/首先图由 AI 辅助生成本文是专业学术比如文解读,不做医疗提议。
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